Preparació d'anticossos i preparació d'estàndards: Hi ha dues opcions per a la preparació d'anticossos. Un és fermentar i purificar les cèl·lules hoste segons el procés de producció establert, i després immunitzar els animals amb la proteïna HCP obtinguda per preparar anticossos; l'altra opció és eliminar els anticossos de la solució de la cèl·lula hoste obtinguda pel procés i després immunitzar els animals. La preparació dels estàndards es pot transformar en cèl·lules hostes mitjançant plasmidis buits, i fermentar i purificar segons el procés de producció establert.
Purificació aigües avall: generalment, la recuperació de productes recombinants expressats en sistemes cel·lulars cultivats comença amb la recol·lecció de fluids de cultiu cel·lular (HCCF), seguida d'una sèrie de passos de processament aigües avall (DSP). Aquests passos DSP no només permeten la recuperació del producte, sinó que també posen l'accent en l'eliminació d'impureses relacionades amb el procés (incloent HCP) i les impureses relacionades amb el producte (com ara els àrids). El resultat final és una proteïna recombinant amb un nivell de HCP inferior a 100 ppm i un agregat immunogènic d'alt pes molecular inferior al 5%.
Caracterització i quantificació de l'HCP: el mètode més utilitzat per a la caracterització i quantificació de l'HCP és l'assaig immunosorbent lligat a enzims (ELISA); Amb el desenvolupament de la tecnologia de proteòmica, es poden utilitzar mètodes ortogonals relatius a ELISA, com ara l'electroforesi de diferència de fluorescència bidimensional (2D-DIGE), cromatografia líquida-espectrometria de masses (LC-MS) i altres tecnologies d'espectrometria de masses per a la caracterització i l'anàlisi de HCP , i pot verificar de manera més objectiva i exhaustiva l'especificitat de la detecció d'ELISA HCP i la cobertura real de l'HCP. Ara, prenent com a exemple la tecnologia 2D-DIGE, es resumeixen els passos de detecció de l'HCP: prendre dos gels idèntics per realitzar una electroforesi bidimensional a la mateixa mostra d'HCP purificada, una de les quals s'utilitza per a l'experiment d'immunoblotting, transferir la proteïna HCP al gel a la membrana, i després s'incuba i s'uneix amb l'anticòs HCP, es renta i escaneja per ECL o fluorescència, etc.; l'altre s'escaneja amb tinció de plata; les taques de proteïnes dels dos gels es combinen i s'analitzen en un programari d'anàlisi dedicat i es calculen els resultats de la cobertura.